In attuazione delle deleghe conferite, l'Autorità di gestione (AdG) ha emanato l'atto che regola i rapporti tra l'AdG e gli Organismi intermedi (OO.II.).

La Direttiva operativa disciplina le modalità e le procedure di attuazione del POIn, in merito a:

1. la separazione delle funzioni;
2. la selezione delle operazioni da ammettere a finanziamento mediante procedure ad evidenza pubblica;
3. l'ammissione a finanziamento delle operazioni;
4. l'erogazione del finanziamento;
5. la selezione delle operazioni mediante procedura negoziata;
6. le spese ammissibili;
7. i costi diretti e indiretti;
8. i progetti generatori di entrata;
9. le modalità di rendicontazione;
10. le misure e modalità di concessioni di aiuti;
11. i Grandi progetti;
12. gli strumenti della verifica e controllo;
13. la comunicazione delle irregolarità;
14. la revoca e recupero del finanziamento;
15. la stabilità delle operazioni (vincolo di destinazione);
16. il monitoraggio dell'attuazione del Programma;
17. l'informazione e pubblicità.

Direttiva operativa 3 maggio 2013

Bozza di disciplinare regolante i rapporti tra l'Organismo intermedio ed il Soggetto beneficiario del finanziamento per interventi infrastrutturali